Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms