Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms