Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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