Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms