Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COBLL1Q53SF7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms