Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms