Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf22Q49AR2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf22Q49AR2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms