Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms