Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms