Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms