Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FSCN1Q16658 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms