Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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