Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PCSK7Q16549 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PCSK7Q16549 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PCSK7Q16549 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PCSK7Q16549 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PCSK7Q16549 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PCSK7Q16549 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PCSK7Q16549 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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