Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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