Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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