Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms