Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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