Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CDSNQ15517 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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