Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms