Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NCOA4Q13772 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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