Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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