Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms