Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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