Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms