Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TOP3AQ13472 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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