Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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