Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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