Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms