Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms