Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms