Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSG1Q02413 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms