Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APBA1Q02410 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms