Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
MS4A2Q01362 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms