Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms