Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNB1P98172 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms