Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms