Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms