Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CLDN17P56750 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN17P56750 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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