Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP7P55210 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP7P55210 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP7P55210 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms