Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHBP55084 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms