Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSE1LP55060 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms