Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST2P52849 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST2P52849 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDST2P52849 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms