Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HK3P52790 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HK3P52790 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HK3P52790 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HK3P52790 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms