Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSEN1P49768 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms