Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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