Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms