Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGIRP43119 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms