Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GDF5P43026 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GDF5P43026 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GDF5P43026 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GDF5P43026 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GDF5P43026 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms