Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHKAP35790 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHKAP35790 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHKAP35790 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHKAP35790 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHKAP35790 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHKAP35790 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHKAP35790 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHKAP35790 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHKAP35790 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHKAP35790 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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