Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms