Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms